海水缸开缸的器材之一就是蛋白质分离器，那么如何选购蛋白质分离器才能适合自己的缸体大小，达到除污目的呢？
了解如何选购蛋白质分离器，首先要明确的两条宗旨是：蛋白质分离器其须要发挥自身功效，一方面能够将有机物分解成有毒废物前将其分离出去，减轻生化系统的负担；二是增加水中的溶氧量。其次，如何选购蛋白质分离，要知道目前市场上常见的几种蛋白质分离器的种类，有气泡石式（Airstone）、针叶式（Needle Wheel）、Venturi式、气阀式（beckett）。
上述所言的四种蛋白质分离中，气泡石式蛋白质分离器多用在微缸海水缸，因为其内部材料原料决定其仅能推动较小的水量，所以适合饲养很少生物的小型海水缸。
而Venturi式比气泡石式好很多，但功率不是很突出，所以也多用于中小型海水缸，其有一只出水管方便调整水位.。但需要注意的是，要问清商家，有大面积的污水存储处、且较为容易拆洗的设备。市面上有台制的Macro及无数小品牌就采用此设计.
针叶式蛋白质分离器，适用于中型硬骨珊瑚及一些对水质要求较高的海洋生物的海水饲养缸，是属当前功效较好，易清洗、效能高。针叶式蛋白质分离器打出的气泡细且多。
气阀蛋白质分离器，适合大型的海水鱼缸和珊瑚缸，并且搭配选购压力较大的马达来满足其打水量；另外，应尽量选购高度较高的设计，这样能够延长水存在于蛋白质分离器内的时间，提高水质质量。
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